Suministro de una plataforma de secuenciación masiva en paralelo y un sistema de análisis de los datos obtenidos para la Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica (FPGMX)

Fundación Pública Galega Medicina Xenómica (FPGMX)

El contrato consiste en el suministro de una plataforma de secuenciación masiva en paralelo y un sistema de análisis de los datos obtenidos para la FPGMX. Dicho suministro debe responder a una solución integrada para secuenciar y analizar exomas y genomas humanos a gran escala y compuesta por un equipo de secuenciación masiva y un sistema de análisis de los datos generados por dicho secuenciador de alto rendimiento.

Plazo

El plazo para la recepción de ofertas era de 2021-03-25. La contratación se publicó en 2021-02-11.

Proveedores

Los siguientes proveedores se mencionan en decisiones de adjudicación u otros documentos de contratación:

• Illumina Productos de España, S. L. U.

¿A quién?

• Fundación Pública Galega Medicina Xenómica (FPGMX)

¿Cómo?

• Aparatos de detección y análisis › Analizadores

¿dónde?

• Galicia › A Coruña

Historial de adquisiciones

Fecha	Documento
2021-02-11	Anuncio de licitación
2021-06-21	Anuncio de adjudicación de contrato

Anuncio de licitación (2021-02-11)
Objeto
Alcance de la contratación
Título: Analizadores
Número de referencia: AB-FMX1-21-002
Breve descripción:

Metadatos del anuncio
Idioma original: español 🗣️
Tipo de documento: Anuncio de licitación
Naturaleza del contrato: Suministros
Reglamentación: Unión Europea con participación de Estados ACP
Vocabulario común de contratación pública (CPV)
Código: Analizadores 📦
Código CPV adicional: Analizadores 📦
Lugar de ejecución
Región NUTS: A Coruña 🏙️

Procedimiento
Tipo de procedimiento: Procedimiento abierto
Tipo de oferta: Oferta para todos los lotes
Criterios de adjudicación
Oferta más económica

Autoridad contratante
Identidad
País: España 🇪🇸
Tipo de poder adjudicador: Otros
Nombre del poder adjudicador: Fundación Pública Galega Medicina Xenómica (FPGMX)
Dirección postal: Hospital Clínico, edificio Consultas, planta menos 2
Código postal: 15706
Ciudad postal: Santiago de Compostela
Contacto
Dirección de internet: https://xenomica.sergas.gal/ 🌏
Correo electrónico: medicinaxenomica.santiago@sergas.es 📧
Teléfono: +34 981951491 📞
Fax: +34 981951473 📠
URL de los documentos: https://www.contratosdegalicia.gal/ 🌏
URL de participación: https://silex.conselleriadefacenda.es/SLE_Internet/ 🌏

Referencia
Fechas
Fecha de envío: 2021-02-11 📅
Fecha límite de presentación: 2021-03-25 📅
Fecha de publicación: 2021-02-16 📅
Identificadores
Número de anuncio: 2021/S 032-079154
Número del DO-S: 32
Información complementaria

Anexos de los pliegos: — anexo I: declaración responsable complementaria al DEUC, — anexo II: índice contenido sobre C (entre otros: precio, características mínimas, encuesta técnica, encuesta técnica de integración), — anexo III: características valorables, — anexo IV: declaración sobre cumplimiento de normativa aplicable al equipo ofertado.

Objeto
Alcance de la contratación
Valor total estimado: 1 150 000 EUR 💰
Breve descripción:

El contrato consiste en el suministro de una plataforma de secuenciación masiva en paralelo y un sistema de análisis de los datos obtenidos para la FPGMX. Dicho suministro, como solución integrada, debe cumplir los siguientes requisitos:

1) equipo de secuenciación masiva:

— sistema de secuenciación masiva capaz de generar hasta 6Tb por carrera,

— capacidad de secuenciación flexible que permita abarcar experimentos que requieran entre 800 y 10.000 millones de lecturas single-end,

— compatible con distintas aplicaciones como la secuenciación de genoma completo (WGS), secuenciación de exoma (WES), estudios de metilación con ADN tratado con bisulfito tanto para genoma completo como paneles, paneles de genes y RNAseq,

— posibilidad de secuenciar muestras con baja cantidad de ADN y calidad comprometida incluyendo célula única,

— longitud de lectura flexible de hasta 150 pb con opción paired end y single end con tasa de error menor del 1.5 % y valores de calidad Q30 para más del 75 % de las bases en runs de 2x150 bp.

2) sistema de análisis de datos:

— servidor para el análisis en local de los datos generados por el secuenciador de alto rendimiento,

— se requiere formato tipo rack, a instalar en la localización que finalmente determine la FPGMX,

— solución de hardware flexible que permita implementaciones aceleradas de forma nativa, preferentemente tecnología FPGA,

— incluirá licencia de software necesario para realizar el mapeo y alineamiento de las lecturas generadas en el secuenciador, detección de variantes tanto germinales como somáticas, CNVs y análisis de ARN, que deberá mantenerse actualizada y operativa por un mínimo de tres años.

Valor estimado sin IVA: 1 150 000 EUR 💰
Duración: 3 meses
Información complementaria:

Anexos de los pliegos:

— anexo I: declaración responsable complementaria al DEUC,

— anexo II: índice contenido sobre C (entre otros: precio, características mínimas, encuesta técnica, encuesta técnica de integración),

— anexo III: características valorables,

— anexo IV: declaración sobre cumplimiento de normativa aplicable al equipo ofertado.

Información jurídica, económica, financiera y técnica
Condiciones de participación
Habilitación para el ejercicio de la actividad profesional: La correspondiente para la ejecución del suministro objeto del contrato.
Ejecución del contrato
Condiciones de ejecución del contrato:

— la ejecución del contrato se realizará a riesgo y ventura del contratista,

— los efectos, modificación y extinción de los contratos que celebre la FPGMX como poder adjudicador, se regirán por las normas a que hace referencia el párrafo segundo artículo 26.3 de la LCSP y por los pliegos de cláusulas administrativas y de prescripciones técnicas,

— los contratos deberán cumplirse a tenor de sus cláusulas,

— se establecen en relación con este contrato condiciones especiales de ejecución de acuerdo con el artículo 202 de la Ley de Contratos del Sector Público (LCSP) y tendrán la consideración de obligaciones contractuales esenciales a los efectos considerados en la letra f) del artículo 211 de la LCSP y carácter de infracción grave para los efectos establecidos en el artículo 71.2 c) de la LCSP en caso de incumplimiento. Dichas condiciones especiales de ejecución figuran descritas en los pliegos.

Procedimiento
Base jurídica: 32014L0024
Hora de recepción de las ofertas: 14:00
Lenguas en las que pueden presentarse las ofertas o solicitudes de participación: español 🗣️
gallego 🗣️
Fecha de apertura de ofertas: 2021-04-05 📅
Hora de apertura de ofertas: 11:00
Lugar: La apertura pública del sobre electrónico B se realizará en las instalaciones de la Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica en acto público asistencial o por comparecencia telemática con empleo de medios electrónicos.
Información complementaria:

— la mesa de contratación estará constituida de conformidad con lo previsto en el artículo 326 de la LCSP,

— el régimen de funcionamiento de la mesa de contratación será el previsto en el PCAP.

1.º: apertura sobre electrónico A (comprobación de la documentación general),

2.º: apertura pública y valoración de lo contenido en el sobre electrónico B.

Autoridad contratante
Identidad
Número de registro nacional: ESG-15926488
Otro tipo de poder adjudicador: Fundación pública
Contacto
Punto de contacto: Fernando Domínguez Puente
URL de los documentos: https://www.contratosdegalicia.gal/ 🌏
Dirección de internet: https://silex.conselleriadefacenda.es/SLE_Internet/ 🌏

Referencia
Información complementaria

— plazo de entrega: seis semanas desde la formalización del contrato,

— plazo garantía mínimo: tres años (incluye un mantenimiento integral, preventivo y correctivo, sin exclusiones de piezas, mano de obra y/o desplazamientos,

— importe garantía definitiva: 5 % del presupuesto base de licitación (excluido el IVA),

— obligatoriedad de incluir en la oferta la parte del contrato que tenga previsto subcontratar,

— obligatoriedad del futuro contratista de respetar la normativa vigente en materia de protección de datos,

— el lugar concreto para la asistencia presencial en la Fundación o la forma específica para la comparecencia telemática al acto previsto de apertura del sobre electrónico B se indicarán con antelación suficiente únicamente en el perfil del contratante. En el supuesto de que la fecha de dicho acto de apertura se modificase, se hará pública la nueva fecha en el perfil del contratante con antelación a su celebración.

Información complementaria
Órgano de revisión
Nombre: Tribunal Administrativo de Contratación Pública de Galicia-TACGal (recurso especial contratación); Juzgado de lo Contencioso-Administrativo de Santiago de Compostela (recurso contencioso-administrativo)
Dirección postal: Rúa Raxeira, 52, 2.º (TACGal); edificio Juzgados, Polígono Fontiñas, c/ Viena, s/n (Juzgado Contencioso-Administrativo)
Ciudad postal: Santiago de Compostela
Código postal: 15781; 15703
País: España 🇪🇸
Teléfono: +34 881995481 / 981540463 📞
Correo electrónico: tacgal@xunta.gal 📧
Fax: +34 881995485 / 981540464 📠
Dirección de internet: https://tacgal.xunta.gal/procedimientos.html 🌏
Información sobre los plazos de procedimientos de recurso:

— recurso especial en materia de contratación: actuaciones relacionadas en el apartado 2 del artículo 44 de la LCSP, pudiendo ser objeto de dicho recurso las decisiones mencionadas en dicho precepto,

— la legitimación para interponer el recurso especial, la iniciación del procedimiento, el plazo, la forma y el lugar de interposición se recogen en los artículos 48,49,50 y 51 de la LCSP.

Los defectos de tramitación que afecten a actos distintos de los contemplados en el apartado 2 del artículo 44 de la LCSP, podrán ser puestos de manifiesto por los interesados al órgano al que corresponda la instrucción del expediente o al órgano de contratación, a efectos de su corrección con arreglo a derecho, y sin perjuicio de que las irregularidades que les afecten puedan ser alegadas por los interesados al recurrir el acto de adjudicación.

— las cuestiones relativas a la preparación y adjudicación del contrato, en los casos en que no proceda la interposición del recurso especial, podrán ser objeto de recurso, de conformidad con lo dispuesto en la Ley 39/2015 de 1 de Octubre del Procedimiento Administrativo Común de las Administraciones Públicas ante el titular de la Consellería de Sanidad de la Xunta de Galicia.

Servicio del que puede obtenerse información sobre el procedimiento de recurso
Nombre: Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica (FPGMX)
Dirección postal: Hospital Clínico, edificio Consultas, planta menos 2
Código postal: 15706
Teléfono: +34 981951491 📞
Correo electrónico: medicinaxenomica.santiago@sergas.es 📧
Fax: +34 981951473 📠
Dirección de internet: https://xenomica.sergas.gal/ 🌏
Fuente: OJS 2021/S 032-079154 (2021-02-11)

Anuncio de adjudicación de contrato (2021-06-21)
Objeto
Alcance de la contratación
Valor total de la contratación: 1148261.95 EUR 💰
Metadatos del anuncio
Tipo de documento: Anuncio de adjudicación de contrato

Procedimiento
Tipo de oferta: No procede

Autoridad contratante
Identidad
Dirección postal: Hospital Clínico, edificio Consultas, planta -2

Referencia
Fechas
Fecha de envío: 2021-06-21 📅
Fecha de publicación: 2021-06-25 📅
Identificadores
Número de anuncio: 2021/S 121-318942
Se refiere al anuncio: 2021/S 032-079154
Número del DO-S: 121

Objeto
Alcance de la contratación
Breve descripción:

— sistema de secuenciación masiva capaz de generar hasta 6 TB por carrera,

— capacidad de secuenciación flexible que permita abarcar experimentos que requieran entre 800 y 10 000 millones de lecturas single-end,

— longitud de lectura flexible de hasta 150 pb con opción paired end y single end con tasa de error menor del 1,5 % y valores de calidad Q30 para más del 75 % de las bases en runs de 2x150 bp;

— incluirá licencia de software necesario para realizar el mapeo y alineamiento de las lecturas generadas en el secuenciador, detección de variantes tanto germinales como somáticas, CNV y análisis de ARN, que deberá mantenerse actualizada y operativa por un mínimo de tres años.

Procedimiento
Criterios de adjudicación
Criterio de calidad (nombre): Ampliación plazo de garantía
Criterio de calidad (ponderación): 10
Criterio de calidad (nombre): Suministro kits de reactivos y fungibles
Criterio de calidad (ponderación): 8
Criterio de calidad (nombre): Actualización y extensión de licencia del software del servidor
Criterio de calidad (ponderación): 5
Criterio de calidad (nombre): Secuenciador: nueve items calidad
Criterio de calidad (ponderación): 36
Criterio de calidad (nombre): Sistema de análisis de datos
Criterio de calidad (ponderación): 16
Precio (ponderación): 25

Adjudicación del contrato
Fecha de celebración del contrato: 2021-06-21 📅
Nombre: Illumina Productos de España, S. L. U.
Número de registro nacional: B-86268125
Dirección postal: C/ Pablo Ruiz Picasso, 1, Torre Picasso, 4.ª planta
Ciudad postal: Madrid
Código postal: 28020
País: España 🇪🇸
Teléfono: +34 637212048 📞
Correo electrónico: tendersemea@illumina.com 📧
País: Madrid 🏙️
Dirección de internet: https://www.illumina.com/ 🌏
Valor total de la contratación: 1148261.95 EUR 💰
Información sobre licitaciones
Número de ofertas recibidas: 1

Referencia
Información complementaria

— plazo garantía mínimo: tres años (incluye un mantenimiento integral —preventivo y correctivo— sin exclusiones de piezas, mano de obra y/o desplazamientos,

— el lugar concreto para la asistencia presencial en la Fundación o la forma específica para la comparecencia telemática al acto previsto de apertura del sobre electrónico B se indicarán con antelación suficiente únicamente en el Perfil del Contratante. En el supuesto de que la fecha de dicho acto de apertura se modificase, se hará pública la nueva fecha en el Perfil del Contratante con antelación a su celebración.

Información complementaria
Órgano de revisión
Nombre: Tribunal Administrativo de Contratación Pública de Galicia (Tacgal) (recurso especial contratación); Juzgado de lo Contencioso-Administrativo de Santiago de Compostela (recurso contencioso-administrativo)
Dirección postal: C/ Raxeira, 52, 2.º (Tacgal); polígono Fontiñas, c/ Viena, s/n, edificio Juzgados (Juzgado Contencioso-Adminsitrativo)
Código postal: 15781, 15703
Información sobre los plazos de procedimientos de recurso:

— la legitimación para interponer el recurso especial, la iniciación del procedimiento, el plazo, la forma y el lugar de interposición se recogen en los artículos 48, 49, 50 y 51 de la LCSP.

— las cuestiones relativas a la preparación y adjudicación del contrato, en los casos en que no proceda la interposición del recurso especial, podrán ser objeto de recurso, de conformidad con lo dispuesto en la Ley 39/2015, de 1 de octubre, del Procedimiento Administrativo Común de las Administraciones Públicas ante el titular de la Consellería de Sanidad de la Xunta de Galicia.

Servicio del que puede obtenerse información sobre el procedimiento de recurso
Dirección postal: Hospital Clínico, edificio Consultas, planta -2
Fuente: OJS 2021/S 121-318942 (2021-06-21)

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